Белки вируса иммунодефицита крупного рогатого скота (штамм R29)

Белки вируса иммунодефицита крупного рогатого скота (штамм R29)

Virion infectivity factor (фактор инфективности вириона) (Q protein) –определяет инфекционность вируса;

Белок Rev – сопровождает неядерные или не полностью сплайсированные вирусные пре-мРНК из ядра инфицированных клеток. Эта функция является очень важной, так как большинство вирусных белков транслируется из не сплайсированных или частично сплайсированных пре-мРНК, которые не могут покинуть ядро путем клеточных мРНК.

Белок Tat (трансактивирующий регуляторный белок) – ядерный транскрипционный активатор экспрессии вирусных генов, который необходим для вирусной транскрипции с промотора LTR и репликации.

Полипротеин Gag:

1) Матричный белок p16 образует внешнюю оболочку ядра вируса, выстилая внутреннюю поверхность вирусной мембраны.

2) Капсидный белок p26 образует коническое «ядро» вируса, которое инкапсулирует геномный комплекс РНК-нуклеокапсид. Взаимодействие между поступающими частицами Gag-белками и динеином^[1] клетки обеспечивает внутриклеточный транспорт вируса в перинуклеарную область до интеграции в геном хозяина.

3) Нуклеокапсидный белок p13 инкапсулирует и защищает вирусную димерную сплайсированную (геномную) РНК.

Env гликопротеин (оболочечный гликопротени) – поверхностный белок (SU) присоединяет вирус к клетке-хозяину, связываясь с его рецептором.

Трансмембранный белок (ТМ) – действует как вирусный белок слияния. Во время слияния вирусной и клеточной мембран-мишеней области спиральной спирали (повторы гептад) принимают структуру шпилек тримера, размещая пептид слияния в непосредственной близости от С-концевой области эктодомена. Образование этой структуры, по-видимому, стимулирует последующее слияние вирусных и целевых клеточных мембран. Слияние мембран приводит к доставке нуклеокапсида в цитоплазму.

Белки вируса миксоматоза кролика (штамм Uriarra)

Probable host range protein 2-1 – способствует размножению вируса в клетках разных типов.

ДНК-направленная РНК-полимераза 21 кДа субъединица – часть ДНК-зависимой РНК-полимеразы, которая катализирует транскрипцию вирусной ДНК в РНК с использованием четырех рибонуклеозидтрифосфатов в качестве субстратов. Отвечает за транскрипцию ранних, промежуточных и поздних генов. ДНК-зависимая РНК-полимераза связывается с фактором ранней транскрипции (ETF), тем самым обеспечивая раннюю транскрипцию генов. Поздняя транскрипция и, возможно, также промежуточная транскрипция требуют новой синтезированной РНК-полимеразы.

Кап-специфическая мРНК (нуклеозид-2'-O-)-метилтрансфераза – участвует в модификации как концов мРНК, так и в промежуточного и позднего ген-позитивного удлинения транскрипции. На 5'-конце мРНК метилирует 2'-О-группу рибозы первого транскрибированного нуклеотида, в результате чего образуется 2'-O-метилпурин-колпачок. На 3'-конце функционирует как фактор процессивности, который стимулирует активность вирусной поли (А) полимеразы VP55, которая создает поли (А) хвост мРНК. В присутствии VP39 VP55 не отделяется от РНК, что позволяет удлинить хвост примерно до 250 аденилатов.