Вирус томатного кустарника

Вирус томатного кустарника (TBSV) был впервые описан в Англии в 1935 году (1) и в настоящее время признан во многих странах Европы, Средиземноморья, Северной и Южной Америки. В некоторых странах она вызывает экономические проблемы, связанные с выращиванием томатов, но в целом не признается в качестве серьезной проблемы. Было найдены, что заражает несколько других видов завода естественно, и свой искусственный ряд хозяина широк. Хотя вирус легко распространяется через посевы, конкретного переносчика выявлено не было. Он передается при контакте и через почву и встречается в реках, что может объяснять его загрязнение на большие расстояния. Вирус встречается в высоких концентрациях в зараженных растениях, стабилен и легко очищается. Таким образом, это была хорошая модель для исследований структуры вирусов и базовой молекулярной биологии.

TBSV является типом-членом рода Tombusvirus, который в настоящее время содержит 13 видов.

1. Структура Вируса

Вирион TBSV является изометрическим, диаметром около 30 нм (рис. 1). Он состоит из одного типа белка оболочки, инкапсулирующего одну (+) - цепочку линейной молекулы РНК размером около 4,7кб. Детальные структуры вирионов и белковых оболочек были определены с помощью электронной микроскопии и рентгеновской кристаллографии. Фактически, TBSV был первым вирусом, который показал икосаэдрическую симметрию (2) и, таким образом, сформировал основу нашего понимания изометрической структуры вируса. 180 субъединиц белка оболочки вирусной частицы расположены в симметрии Т = 3 (см. Структура вируса), и структура вириона была определена с разрешением 2,9 А. Каждая субъединица белка оболочки содержит 387 аминокислот, которые объединены в три отдельных домена. N-концевой домен (домен R) состоит из 66 остатков с высокой долей основных аминокислот и взаимодействует внутри с РНК. Это связано плечом из 35 остатков с остальной частью молекулы, которая состоит из домена глобулярной оболочки (S) (167 остатков) и выступающего на поверхность домена (P) (114 аминокислот); домены S и P связаны гибким шарниром из пяти остатков. P-домены сгруппированы в 90 димеров, что важно для сборки и стабильности вириона. Домен S образует бочковидную структуру, состоящую из восьми бета-нитей, которая в настоящее время признана характерной для белков оболочки многих изометрических вирусов. 180 субъединиц белка оболочки вирусных частиц имеют три различные квазиэквивалентные конформации, которые необходимы для упаковки икосаэдрической симметрии. Конформации A и B очень похожи, с неупорядоченным N-.