Исследование структуры гена ACACA

МИНИСТЕРСТВО НАУКИ И ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ РФ

федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение

высшего образования

«Санкт-Петербургский государственный технологический институт

(технический университет)»

СПбГТИ(ТУ)

Практическая работа №3

Студент                         Совестнов Александр Юрьевич

Направление                19.03.01 Биотехнология

Уровень высшего         Бакалавриат

образования

Направленность                Биотехнология

бакалавриата

Факультет                         Химической и биотехнологии

Кафедра                         Молекулярной биотехнологии

Группа                         294

Профильная

организация         СПбГТИ(ТУ)

Преподаватель               Новикова Д.С.

Тема                                Исследование структуры гена ACACA

                                     Ген АСАСА

АСАСА (альтернативные названия: ACAC, ACACAD, ACC, ACC1, ACCA, acetyl-CoA carboxylase alpha, ACACalpha, Acac1, hACC1, ACCalpha) –ген, кодирующий Ацетил-КоА карбоксилазу 1. 17q12

У человека ген расположен на 17 хромосоме, на длинном плече, в области 1, бенд 2. Локализация на геномной последовательности NC_000017.11 с 37,084,992 по 37,406,836 bp (321,845 нуклеотидов). 66 экзонов.

[pic 1]

[pic 2][pic 3][pic 4]

[pic 5]

                                         Энхансер

На сайте библиотеки NCBI энхансер для гена ACACA не был найден. Далее поиск энхансера осуществлялся в базе данных энхансеров, предсказанных на основе экспериментальных данных, EnhancerAtlas 2.0.

Длина энхансера 324,986 нуклеотидов, локализация на геномной последовательности

NC_000017.11 с 35,441,923 по 35,766,909 нуклеотид.

Располагается в позиции -1,318,083 от сайта инициации транскрипции.

                                                        Промотер.

Промотер АСАСА_1 aagccccgccccttctccgtgtgccgggccggcctggtgctgcacgcctGTCAGCCATCG,

позиция на геномной последовательности NC_000017.11 37,359,096 нуклеотид.

Промотер АСАСА_1 cgcccccgggcggcgcagtggcgagcgcgccgcgtgccgcgcgcccgccGCCTCCGCCCC, позиция на геномной последовательности NC_000017.11 37,406,833 нуклеотид.

                                       Элементы промотера.

                             Сайт инициации транскрипции.

Позиция на геномной последовательности NC_000017.11 37,406,836 нуклеотид.

                                                3’ нетранслируемая область.

Длина- 535 нуклеотид. Положение на геномной   последовательности NC_000017.11 с 37,406,300 по 37,406,836 нуклеотид.

                                    5’ нетранслируемая область.

Длина – 2,324 нуклеотид. Положение на геномной   последовательности NC_000017.11 с 37,084,992 по 37,087,316 нуклеотид.

                                Сайт терминации транскрипции.

Позиция на геномной последовательности NC_000017.11 37,084,992 нуклеотид.

                              Открытая рамка считывания.[pic 6]

                                                                                                                       Старт кодон[pic 7]

[pic 8]

                                                                                                                                       [pic 9]

                                                                                                                                     Стоп кодон

                                                Экзоны.